Le baptistère a été construit en 1791 par le cardinal Giovanni Francesco Albani sur un plan octogonal symbolisant la résurrection (sept sont les jours de la Création, le huitième est le jour supplémentaire, l’éternité), tandis que la fontaine est à trois panneaux et symbolise la Sainte Trinité.
Le baptistère a été restauré en 1998. Le plan octogonal est un symbole de résurrection ; les fonts baptismaux, sculptés par Francesco Saverio Moschetti de Monte Giorgio, ont trois ailes et symbolisent la Sainte Trinité. Le miroir principal représente le précurseur saint Jean-Baptiste en train de baptiser le Sauveur. À l’intérieur de la fontaine se trouve une vasque en cuivre portant les armoiries des Albani.
Sur les murs, quatre lunettes racontent l’histoire du péché originel ; le pélican peint est un symbole allégorique faisant référence à l’Eucharistie. Le cerf, l’autruche, le lion et l’éléphant, représentés sur les murs, symbolisent les quatre vertus cardinales.